Hasadó élesztő sejtek növekedésének vizsgálatára szolgáló time-lapse felvételek készítése, illetve a kiértékelési módszer validálása

A Schizosaccharomyces pombe (hasadó élesztő) egyike a legszélesebb körben használt eukarióta modellorganizmusoknak, így növekedésének vizsgálata digitális elemzési módszerek használatával fontos ismeretekkel szolgálhat a faj méretkonrolljának működéséről. Dolgozatom célja a hasadó élesztő vad típusú és wee1Δ mutáns sejtjeiről készült mikroszkópos time-lapse felvételek, illetve a digitális kiértékelés módszer validálása.

Az élesztősejtekről készült felvételeket a Debreceni Egyetem Genetikai és Alkalmazott Mikrobiológiai Tanszékén végeztük el, a tanszék munkatársainak segítségével. A fényképek elkészítéséhez a sejtszuszpenzió egy cseppjét Petri-csészébe öntött agarlemezre pipettáztuk. Az állandó 35°C-os hőmérsékletet vízkeringetéses Petri-csésze melegítővel biztosítottuk. A körülmények beállítását és a vizsgálat céljából megfelelő sejtsűrűségű felület kiválasztását követően elindítottuk a mérést. A digitális felvételek készítésére alkalmas mikroszkóp segítségével hat órán keresztül, két percenként lefényképeztük a sejteket, így egy mérés eredményeként 180 képet kaptunk.

A méréseket képenként az ImageJ nevű képfeldolgozó programmal végeztem el. A program az eredményeket képpontokban adja meg, a sejtek mikrométerben mért méretéhez szükséges arányszámot a felvételek végén fotózott mikrométerskálán végzett mérések átlagából határoztam meg.

Kellő számú sejt lemérését követően az adatpontok alapján az ún. Akaike Információs Kritérium segítségével meghatároztam, hogy a szakirodalomban korábban felmerült modellek (lineáris, bilineáris, exponenciális) közül az adott sejt növekedési mintázatára melyik függvény illeszkedik legpontosabban. Célom a kapott új adatok és az irodalomban jegyzett korábbi eredmények összehasonlításával az új felvételkészítési és kiértékelési módszerek bírálata és elismertetése.

szerző

Szabó Bendegúz
Biomérnöki alapképzési szak, nappali BSC
alapképzés (BA/BSc)

konzulens

Dr. Sveiczer Ákos
egy. docens, Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék